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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),注册于2014年12月31日,次年10月正式开始对外运营,是一家专业提供表观组学技术服务、高通量测序、单细胞测序分析的新型生物科技服务企业。

公司总员工已达到百余人,其中95%以上具有学士学位,40%以上具有硕士及以上学位,专职科研人员20余人,专职销售人员30余人,覆盖全国90%的省市,核心成员来自国内知名高效、基因测序公司、信息分析公司等。

公司运营至今销售额累积1亿左右,成为国内成长最迅速的二代测序与生物科研服务企业之一。




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TECHNOLOGY SERVICE

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详细说明

ChIP-seq

  • 产品介绍
  • 案例分享

ChIP-seq(Chromatin Immunoprecipitation with highthroughput sequencing )


产品介绍

将染色质免疫共沉淀与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息。

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1 ChIP-seq技术原理示意图


技术路线:

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样本要求:

细胞:>5×107 

动物组织:1 g 

植物组织5 g

真核微生物:500 mg


建库测序:

测序策略:Illumina Hiseq, PE150

测序深度:6-12 G


项目周期:

90个工作日


 


案例分析

《跨越20个哺乳动物物种的增强子进化》

Enhancer Evolution across 20 Mammalian Species. Cell, 2015, 160(3):554-566. (IF: 30.410 )


研究背景:

哺乳动物的辐射与基因组非编码区域的快速变化相对应,但我们对哺乳动物的调控进化缺乏全面的认识。


研究结果:

研究人员通过分析H3K27AcH3K4me3的基因组富集,追踪了来自20种哺乳动物肝脏中六种不同顺序的活跃的启动子和增强子的进化。发现增强子的快速进化是哺乳动物基因组的一个普遍特征。大多数最近进化的增强子来自祖先DNA的适应,而不是谱系特异性重复元件的扩展。相反,几乎所有的肝脏启动子在这些物种中都是部分或完全保守的。进一步发现,最近进化的增强子可以与正调控下的基因相关联,表明这种方法用于注释基因组序列中调节适应性的能力。这些结果提供了对哺乳动物调控进化的功能遗传学的重要见解。

图片23.png

图:20种哺乳动物的肝脏体内调节活性的评估



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